JGG：中科院昆明动物所张亚平课题组揭示非洲家犬复杂的源流历史

　　摘要:2016年11月24日，国际期刊《JournalofGeneticsandGenomics》杂志上在线发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平研究组题为“AcrypticmitochondrialDNAlinkbetweenNorthEuropeanandWestAfricandogs”的研究论文，研究揭示非洲家犬复杂的源流历史。

　　2016年11月24日，国际期刊《JouRNAlofGENEticsandGenomics》杂志上在线发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平研究组题为“AcrypticmitochondrialDNAlinkbetweenNorthEuropeanandWestAfricandogs”的研究论文，研究揭示非洲家犬复杂的源流历史。助理研究员AdeniyiC.Adeola(尼日利亚籍)为文章第一作者，张亚平研究员和彭旻晟副研究员为共同通讯作者。

　　非洲大陆具有古老而独特的犬种(例如，巴仙吉犬;Basenji)。一些零星的考古学证据表明，家犬可能早在距今8000年前就已在非洲出现，但其来源一直是未解之谜。之前的研究发现非洲家犬群体具有较高的遗传多样度和复杂的遗传结构(Boykoetal.,2009,PNAS)。相关结果也对家犬的东亚起源假说提出了质疑。近期关于家犬单一起源和多次驯化的争辩(Wangetal.,2015,CellRes;Frantzetal.,2016,science)，使得非洲家犬的起源愈发扑朔迷离。

　　为探讨非洲家犬的源流历史，研究人员对来自两个国家一共382份当地家犬样本的线粒体DNA(mtDNA)进行了分析。结合之前已发表的数据，研究结果显示非洲家犬mtDNA世系来自ABCD四个单倍型类群，说明非洲家犬的祖先是灰狼。非洲本地狼和其他犬科动物对非洲家犬的mtDNA基因库没有贡献。值得注意的是，mtDNA单倍型类群D在欧洲和西亚家犬中有低频分布，但东亚家犬中没有分布;提示非洲家犬不可能完全源自东亚。研究人员选取了代表性的样本测定了mtDNA基因组全序列，并结合已发表的序列重建了单倍型类群树。针对单倍型类群D的系统地理学分析揭示非洲家犬与北欧家犬具有较近的关系，最近共同祖先的时间大约距今1.2万年前(如图所示)。相关结果说明部分非洲家犬的母系遗传组分源自欧洲南部冰期后的扩散事件。有意思的是，之前对人群mtDNA单倍型类群U5b1b的研究也得到类似的结果。一个可能的解释是当时非洲家犬的祖先跟随人群一同穿过直布罗陀海峡到达非洲。

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